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利用害蟲(chóng)的習(xí)性進(jìn)行防治：(1)對(duì)菌蚊進(jìn)行人工捕捉。(2)將發(fā)生癭蚊的菌袋放在陽(yáng)光下曝曬1小時(shí)-2小時(shí)或撒上石灰粉。 水浸法防治：瓶栽和袋栽的可將水注入瓶、袋內(nèi)，塊栽的可將栽培塊浸入水中壓上重物，浸泡2小時(shí)- 3小時(shí)。浸泡后的瓶、袋瀝干水后放回原處。
誘殺：(1)對(duì)蚊蛾用黑光燈或節(jié)能燈誘殺。方法是在燈下的水盆中放入0．1％的敵敵畏，害蟲(chóng)落入盆中即被殺死。(2)對(duì)粘蟲(chóng)可在強(qiáng)燈光處放置涂抹了40％聚丙烯的粘蟲(chóng)板。 曲霉的防治：(1)及時(shí)清除廢料。(2)瓶裝料時(shí)料不能與棉塞相接。裝瓶完畢后洗凈瓶口，除去雜物，保持棉塞清潔。(3)施用5毫克／千克的多菌靈，但必須是蘑菇采收完后施用。
綠霉的防治：(1)降低菇房的溫度和濕度，加大通風(fēng)量，用草木灰覆壓有霉菌的地方，阻止霉菌孢子飛揚(yáng)傳播。(2)取生石灰9份、多菌靈 1份、水適量拌勻，洗刷霉菌處。(3)生料栽培時(shí)，每100千克干料中添加克霉靈100克，可徹底防止霉菌滋生。(4)在霉菌處撒上高錳酸鉀顆粒后，再在其外圍噴水。(5)用5％的石灰水浸泡霉菌，待霉菌消失后排掉石灰水，補(bǔ)上新料。(6)在霉菌處涂95％的酒精或煤油，點(diǎn)火將其燒掉，然后挖除，填補(bǔ)新料。
對(duì)細(xì)菌的防冶：(1)培養(yǎng)基滅菌要徹底，滅菌時(shí)溫度、壓力、時(shí)間都要達(dá)到要求。(2)培養(yǎng)基做好后，在 30℃的培養(yǎng)箱內(nèi)放置一天后再用，以確保無(wú)細(xì)菌感染。(3)食用菌培養(yǎng)基內(nèi)可加入抗生素，一般以每毫升100- 200單位為宜。
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